正式揭晓！7大靶点+完整规则，“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛赛题公布
先了解这件事
一个月间 全球 1800+ 支队伍、 4000+ 名选手 20+ 国家和地区参与🌏 "长江杯"正以一股跨越国界的 AI for Science 创新热潮 展现全球蛋白质设计领域的澎湃势能 今日（11 月 1 日） 【7大赛道靶点与完整竞赛规则】 正式公布！ 两大关键节点请务必记牢 报名截止：11 月 30 日 23:59:59 序列提交截止：11 月 30 日 23:59:59 推文内为规则摘要 请前往 大赛官网查看完整赛事细则 👉 https://aiprotein.sjtu.edu.cn/ 01 七大靶点，七大赛道 选手们最关心的靶点🎯 现在公布！ 本届赛事设置7个独立赛道 每个赛道仅接受 一种指定分子类型 每个团队可参加 一个或多个赛道 各赛道 独立筛选、独立验证、独立排名评奖 靶点一：EGFR 靶点名称：EGFR 设计类型：VHH 额外要求：测定在pH=6.0时的亲和力 序列（UniProt编号）：P00533-1 序列范围：Met1-Ser645 参考结构：6ARU chain A 靶点二：TNF-α 靶点名称：TNF-α 设计类型：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P01375 序列范围：Val77-Leu233 参考结构：1TNF chain A、B、C 靶点三：GLP-1R 靶点名称：GLP-1R 设计目标：VHH 额外要求：激动剂（Agonist） 序列（UniProt编号）：P43220 序列范围：Ala21-Glu139 参考结构：6X18 chain R 靶点四：TfR1 靶点名称：TfR1（CD71） 设计目标：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P02786 序列范围：Cys89-Phe760 参考结构：11QC chain A、B 靶点五：TL1A 靶点名称：TL1A（TNFSF15） 设计目标：minibinder 额外要求：无 序列（UniProt编号）：O95150 序列范围：Leu72-Leu251 参考结构：2RE9 chain A、B、C 靶点六：TNFR1 靶点名称：TNFR1（TNFRSF1A） 设计目标：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P19438-1 序列范围：Met1-Thr211 参考结构：9S3I chain A 靶点七：IL-7Rα 靶点名称：IL-7Rα（CD127） 设计目标：minibinder 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P16871-1 序列范围：Met1-Gly236 参考结构：3DI3 chain B 滑动查看更多赛事靶点信息 *靶点相关信息以序列（UniProt编号）和序列范围为准 参考结构仅作展示 02 参赛设计要求 【minibinder赛道】 氨基酸长度： 40—100 aa 分子形式： 单条多肽链、单个设计结合模块 序列要求： 20 种标准天然氨基酸；仅提交成熟蛋白本体，不得自带信号肽、标签、Fc 等融合片段 【VHH赛道】 氨基酸长度： 100—150 aa 分子形式： 单个 VHH 可变结构域，含完整框架和 CDR 序列要求： 20 种标准天然氨基酸；仅提交成熟蛋白本体，不得自带信号肽、标签、Fc 等融合片段 ⚠️ 参赛序列必须从头设计 序列须通过与参考库 的CDR区域比对 03 序列提交方式 进入大赛官网，直接使用报名时提交的 【队长邮箱+队长手机号】 登录 用户名：队长邮箱 初始密码：队长手机号 （*请登录后及时修改登录密码） 进入提交入口，选择对应赛道 上传提交内容 材料一： 设计序列 （*请按照要求使用csv格式） 材料二： 设计摘要 （*不要求公开模型权重、训练集或源代码） 确认提交 关键提醒 报名成功后，需等待一个工作日，方可登录网站，如果有问题请联系官方赛事客服。 截止前可反复更新， 以截止前最后一次成功提交的版本为准 。 与在先提交序列比对，覆盖总长度 > 90% 且一致性 = 100% 的视为重复序列（抗体仅比较CDR区）；跨团队提交的相同/重复分子， 仅保留首次有效提交、归属提交时间优先的团队 。 04 湿实验入围规则 本届赛事计划对约7000条序列 提供免费湿实验验证 计划对 每赛道进行1000条亲和力检测 其中结果排名前50的蛋白 免费增加成药性与细胞活性检测 （*该附加检测不影响主奖按KD排名） 种子队伍 本届比赛总计入围 20支种子团队 ；其按时提交的 全部合规序列直接入围 ，不做质量择优，仅作合规审查。 公开报名团队 按单条序列统一打分排序，由序列得分高到低择优入围 ：结构预测采用 ESMFold2、以 ipSAE 打分；配置为 1 seed、1 sample、无模板，仅靶点序列使用 MSA、所设计蛋白不使用 MSA。 05 排名及获奖规则 本届
摘自 北京智源研究院
报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
- 北京智源研究院精选正式揭晓！7大靶点+完整规则，“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛赛题公布
一个月间 全球 1800+ 支队伍、 4000+ 名选手 20+ 国家和地区参与🌏 "长江杯"正以一股跨越国界的 AI for Science 创新热潮 展现全球蛋白质设计领域的澎湃势能 今日（11 月 1 日） 【7大赛道靶点与完整竞赛规则】 正式公布！ 两大关键节点请务必记牢 报名截止：11 月 30 日 23:59:59 序列提交截止：11 月 30 日 23:59:59 推文内为规则摘要 请前往 大赛官网查看完整赛事细则 👉 https://aiprotein.sjtu.edu.cn/ 01 七大靶点，七大赛道 选手们最关心的靶点🎯 现在公布！ 本届赛事设置7个独立赛道 每个赛道仅接受 一种指定分子类型 每个团队可参加 一个或多个赛道 各赛道 独立筛选、独立验证、独立排名评奖 靶点一：EGFR 靶点名称：EGFR 设计类型：VHH 额外要求：测定在pH=6.0时的亲和力 序列（UniProt编号）：P00533-1 序列范围：Met1-Ser645 参考结构：6ARU chain A 靶点二：TNF-α 靶点名称：TNF-α 设计类型：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P01375 序列范围：Val77-Leu233 参考结构：1TNF chain A、B、C 靶点三：GLP-1R 靶点名称：GLP-1R 设计目标：VHH 额外要求：激动剂（Agonist） 序列（UniProt编号）：P43220 序列范围：Ala21-Glu139 参考结构：6X18 chain R 靶点四：TfR1 靶点名称：TfR1（CD71） 设计目标：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P02786 序列范围：Cys89-Phe760 参考结构：11QC chain A、B 靶点五：TL1A 靶点名称：TL1A（TNFSF15） 设计目标：minibinder 额外要求：无 序列（UniProt编号）：O95150 序列范围：Leu72-Leu251 参考结构：2RE9 chain A、B、C 靶点六：TNFR1 靶点名称：TNFR1（TNFRSF1A） 设计目标：VHH 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P19438-1 序列范围：Met1-Thr211 参考结构：9S3I chain A 靶点七：IL-7Rα 靶点名称：IL-7Rα（CD127） 设计目标：minibinder 额外要求：无 序列（UniProt编号）：P16871-1 序列范围：Met1-Gly236 参考结构：3DI3 chain B 滑动查看更多赛事靶点信息 *靶点相关信息以序列（UniProt编号）和序列范围为准 参考结构仅作展示 02 参赛设计要求 【minibinder赛道】 氨基酸长度： 40—100 aa 分子形式： 单条多肽链、单个设计结合模块 序列要求： 20 种标准天然氨基酸；仅提交成熟蛋白本体，不得自带信号肽、标签、Fc 等融合片段 【VHH赛道】 氨基酸长度： 100—150 aa 分子形式： 单个 VHH 可变结构域，含完整框架和 CDR 序列要求： 20 种标准天然氨基酸；仅提交成熟蛋白本体，不得自带信号肽、标签、Fc 等融合片段 ⚠️ 参赛序列必须从头设计 序列须通过与参考库 的CDR区域比对 03 序列提交方式 进入大赛官网，直接使用报名时提交的 【队长邮箱+队长手机号】 登录 用户名：队长邮箱 初始密码：队长手机号 （*请登录后及时修改登录密码） 进入提交入口，选择对应赛道 上传提交内容 材料一： 设计序列 （*请按照要求使用csv格式） 材料二： 设计摘要 （*不要求公开模型权重、训练集或源代码） 确认提交 关键提醒 报名成功后，需等待一个工作日，方可登录网站，如果有问题请联系官方赛事客服。 截止前可反复更新， 以截止前最后一次成功提交的版本为准 。 与在先提交序列比对，覆盖总长度 > 90% 且一致性 = 100% 的视为重复序列（抗体仅比较CDR区）；跨团队提交的相同/重复分子， 仅保留首次有效提交、归属提交时间优先的团队 。 04 湿实验入围规则 本届赛事计划对约7000条序列 提供免费湿实验验证 计划对 每赛道进行1000条亲和力检测 其中结果排名前50的蛋白 免费增加成药性与细胞活性检测 （*该附加检测不影响主奖按KD排名） 种子队伍 本届比赛总计入围 20支种子团队 ；其按时提交的 全部合规序列直接入围 ，不做质量择优，仅作合规审查。 公开报名团队 按单条序列统一打分排序，由序列得分高到低择优入围 ：结构预测采用 ESMFold2、以 ipSAE 打分；配置为 1 seed、1 sample、无模板，仅靶点序列使用 MSA、所设计蛋白不使用 MSA。 05 排名及获奖规则 本届
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